到了救赎一般，说道。
“渚薰”伸出手似乎要将其拥入怀中。
而碇真嗣却像是解脱了一般，笑着流眼泪，缓缓闭上了双眼。
初号机身后的十字架在“渚薰”伸手的瞬间消失了，然后仅剩初号机和悬在其胸口S2机关上的朗基努斯之枪。
“螺旋曲线反转！”
“自我意识逐渐弱化！”
“力场！图样红色！”
……
NERV总部的指挥人员似乎在说明，现在的碇真嗣和初号机正在逐渐转变为使徒。
“使徒所拥有的生命之果以及人类所拥有的智慧之果……”
冬月看着这一幕，解说道。
伴随着他的解说，只见画面中的初号机那胸前的红色中枢被朗基努斯之枪洞穿……
不！应该说是被朗基努斯之枪融入。
“获得了二者的EVA初号机……”
初号机的身躯在融入了朗基努斯之枪后，逐渐扭曲，变为血红色，螺旋为根干的形状……
“已经等同于神的存在……”
然后根干又蔓延出无数细小的根须，最终真的变为了仿佛生命之树根须的模样。
“又还原了代表生命之芽的生命之树……”
根须蔓延而上，却是在顶部，变为了一个血红色的十字架模样。
“它会成为从第三次冲击的虚无中，拯救人类的方舟吗？”
“还是成为毁灭人类的恶魔呢？”
冬月的表情无比凝重，说道，“未来……已经交到了碇唯的儿子手中……”
此刻NERV总部剩下的人员都充满了紧张，他们甚至都不知道自己这么做是否是正确的。
然后只见那代表生命之树的十字架上，突然冒出无数只眼睛，让人望而生畏。
这生命之树前方，莉莉丝已经从“渚薰”再度变回了“绫波丽”。
“现在的丽，就是你自己的心。”
画面中却出现了似乎已经沉睡在美梦当中的碇真嗣的脸庞，在他脸旁，已经和初号机融为一体的母亲碇唯却再度出现。
就是她在对碇真嗣说话，“就是你自己的愿望……你想祈求什么呢？”
在变换的水波荡漾的特效中，最后一滴涟漪暂停了所有的音乐和话语声。
然后……出现了碇真嗣的回忆。
是碇真嗣小时候的回忆，不过这画面有种旧时代的录像机和V
…。。