军队纷纷四散溃逃。见此情形，李思齐自知继续反抗也不是对手，便主动投降了。
在北伐大军攻略陕西的时候，退守上都的元军蠢蠢欲动，乘虚进攻通州。此时的北平仅驻守少量守备部队，自然不是元军的对手，差点就被元军攻破了。
所幸徐达及时派出常遇春、李文忠统率步骑九万救援北平，不然问题就大了。进攻通州的元军眼见北伐大军又杀回了，急忙逃奔塞外。
常遇春、李文忠见状，则抓住时机，统率大军尾随逃跑的元军出塞，直捣元上都。面对饿狼一般的北伐大军，元顺帝发挥所长，再次施展逃跑技能，带着一家老小北逃沙漠。
北伐大军攻克元上都之后，北平城也转危为安，再无来自北方的危险了。然而，副元帅常遇春突发疾病暴卒，莫名为北伐增添几分悲壮的色彩。
常遇春死后，李文忠率军继续征战，大败围攻大同的元军，生擒脱列伯，阵杀孔兴，狠狠地打压了元军气焰，使得元军闻风丧胆。
元顺帝眼见几次反攻计划都遭遇失败，自知大势已去，在叹了几口气之后，彻底打消了反攻大都的念头。从此，元顺帝定下心来，重新回到他祖宗放牛牧马的蒙古草原，重新去过幕天席地、水草转徙的游牧生活。
实际上，元顺帝还不算最惨的，至少比北宋徽、钦二帝要好很多，做不成统治华夏的中国皇帝，那么做一个称雄漠北的蒙古可汗还是可以的。
徐达统率北伐大军则继续西进。驻守庆阳的张良弼丢下弟弟张良臣，逃奔宁夏，结果被扩廓帖木儿俘虏了。见北伐大军攻势凶猛，此时驻守庆阳的张良臣献城投降。
不久，张良臣鼓动部下反叛。徐达大怒，命令部下进攻庆阳城。城破之后，张良臣被徐达砍掉了脑袋。自此，陕西平定，北伐完结。