总部在济州岛的海军陆战军也与陆军野战军一样，扩编为五万三千人，也下辖的四个师和军部直属旅。其中，骑兵师与军部直属旅驻扎在济州岛，重型师驻扎在流求岛，轻型师驻扎在琼州岛，机动师驻扎在小流求。由于作战任务的特殊性，海军陆战军的大型装备数量甚至还要超过陆军野战军，并配备了大量的运输船，战时还可以征调民商船帮助运输。就训练强度而言，海军陆战军士兵的甚至更大，他们不仅要进行与陆战训练，还要进行抢滩登陆、武装泅渡等专项训练。
按照《海军发展纲要》的造舰计划，霹雳军的每支舰队应装备五艘崇庆府级、二十艘邛州级和四十艘大邑级火炮战舰，共计六十五艘主力战舰。除火炮战舰之外，还应配备大量的侦察船、护卫船、爆破船、火战船等他战船，以及工程船、医疗船、维修船、粮水补给船、弹药补给船、兵马运输船等辅助船只，数量总计四百艘左右。按照《纲要》，霹雳军的每支舰队船只数量为五百艘左右，水兵配备二万人，六支舰队应有四百艘主力战舰，其它各型船只三千艘以上。
截止到霹雳十五年春，霹雳军海军共只有二百二十艘主力战舰，完成了《纲要》进度的百分之四十四，其它各型船只二千余艘，完成进度为三分之二。从各支舰队的进度来看，南洋舰队船只数量最多，其中主力战舰有五十五艘，辅助船只三百余艘，水兵达到了一万五千人。次之的是西洋舰队，有主力战船四十八艘，其它船只二百余艘，有水兵一万二千人。实际上，西洋舰队的战舰曾一度达到了《纲要》规定的九成，但在频繁的征战与风暴中损失不少，最终维持在了当前规模。西洋舰队辖区面积广大，东至锡兰，西至黑人大陆西海岸的财富群岛，该片海域风高浪急，加上有不少敌对势力和海盗，需要不断出动战船进行巡逻、清剿和威慑，出现损失实属正常。
由于牢牢掌握了制海权，加之将精力投到了海情复杂，又能带来大量利润和战略物资的南洋、西洋方向，霹雳军一度对北海、东海、南海三支近海舰队的建设投入不足。眼下这三支舰队的规模则刚过《纲要》的五成，虽然辅助船只则达到了八成以上，水兵数量也达到了七成，但主力战舰都不超过三十艘，总战舰满编率也在四成上下，这还是霹雳十三年时，欧阳轩眼见苗头不对，当即下达措词严厉的命令，要求优先保障这三支舰队建设的结果。在欧阳轩看来，霹雳军高层内部存在一种错误思想，即偏爱能带来财富的西洋、南洋舰队，而忽视了近海舰队建设，忘记了抗蒙才是霹雳军最重要的任务。在欧阳
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