赵屋岭的赵大一直管着作坊事宜，而研制火器的姚家兄弟也极有能力，可他们这些人却出身低微，而且文化水平不高，再加上其他原因在内务府任职没有问题，可要主管一司却根本不可能。
思来想去，朱慎锥就看上了孙元化，孙元化的优点和毛病都很鲜明，如果把孙元化放到其他官职上非但没什么好处，反而会害了孙元化。既然是技术人才，就让他只做技术方面的工作，而且内务府的成立直接把营造的工作从工部中剥离出来，未来也不再受工部管辖，如此朱慎锥就能借内务府名义重起炉灶，通过内务府的营造机构来发展技术，这个地方才是孙元化最好的去处。
按照朱慎锥的想法，给孙元化一个内务府副总管（协理大臣）的职务，这个职务品级虽然不高，相比现在孙元化的官职要低上两级，毕竟内务府刚刚建立，内务府大臣的官职是按照亢有福现有的品级来定的，而协理大臣作为总管大臣的副手自然要再低上一级。
不过未来可不是如此，现在的内务府只是初建，按照朱慎锥的设想以后内务府的地位会越来越高，最终内务府总管大臣的级别会当同于六部尚书品级，而协理大臣也就等同于侍郎的级别。
除去协理大臣外，内务府的营造司会直接交给孙元化来负责，营造司将以赵屋岭的工坊作为基础构架，再把原属于工部营造的部分机构划分给内务府营造司，由此进行整合。