皇帝。在长沙的堵胤锡闻讯破口大骂，甚至想过起兵勤王打算，可还没等他做出安排，朱慎锥以雷霆万钧之势就先解决了几支勤王部队，再拉拢了李太妃，以先帝太妃名义下旨封朱慎锥为郡王，并挟崇祯皇帝下圣旨让其总揽朝政，压制地方。
接下来朱慎锥采取了一系列的政策，在北方长城击退了建奴，随后调集国内军队围剿各地流寇。等最大的流寇高迎祥覆灭后，剩余的流寇流窜于中原各省，朝廷采取了八面张网，步步紧闭的政策进一步围剿，而那时候的堵胤锡为大局考虑配合作战，在彻底剿灭流寇的大战略下立下了功劳。
等平定了内乱后，朝廷又颁布了多项政策，缓和地方矛盾，恢复生产，减免税赋，并拨款赈灾。在这种措施下，堵胤锡也渐渐对朱慎锥有了好感，虽然他当时心中对朱慎锥上位的手段依旧有所非议，但也承认朱慎锥为政能力要比崇祯皇帝强了许多。
等到朱慎锥正式登基后，堵胤锡因为孙传庭的缘故由长沙知府转任西安知府。孙传庭在围剿流寇的时候和堵胤锡打过交道，而且孙传庭作为科举的前辈，早就认识堵胤锡，知道他的能力不俗，当时因为朝廷刚刚设置陕甘总督一职，孙传庭被任命为陕甘总督，而因为战乱和天灾人祸，陕西一地破坏严重，孙传庭急需有能力的助手帮他，所以通过关系把他从长沙给调去了陕西。
到了陕西，堵胤锡在西安知府任上干的非常不错，短短数年中就协助孙传庭稳定了地方，生产也逐步恢复。按理说以他政绩和这些年的官职流转早就应该升官了，其他不讲当一个布政使也足够，可后来孙传庭不肯放他走，希望他能在陕西多留几年，商议后在吏部升迁时想了办法，直接让堵胤锡从山西知府升迁为陕西提督学政，这个职务从级别来说仅次于布政使，但因为学政比较特殊更清贵些。
虽然当了学政，可堵胤锡除去学政的工作外还协助孙传庭负责总督衙门的诸多事务，无论是民政还是军政堵胤锡做起来都得心应手，深得孙传庭的信任。这样一干就是好几年，现在堵胤锡再不升官是不可能了，而孙传庭也不会一直把他留在自己手里，毕竟他仅仅只是一个陕甘总督而已，如此能臣继续在自己手下岂非浪费，也委屈了。
就在这个时候，孙传庭听说了台湾被收复的消息，又听说了皇帝准备在台湾设府进行治理，并且着手准备挑选合适的官员当这个知府。
但挑来选去，皇帝始终没找到合适的人选，得知这个消息后孙传庭顿时心中一动，他立即就想到了堵胤锡。
以堵
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