SEELE，会议室。
老人们注视着月下的漆黑EVA，以及天空中飞翔的六台EVA量产机。
“EVA，Mark.06，牺牲了三台量产机和三个人造S2机关制造出来的自律性机体，祂已经取得了第十三位使者的生命果实，可谓是至今为止最接近神的造物。”
“亚当的灵魂，自己为自己取名为渚薰的第十七位使者，这种情况下，只能借他的手来完成我等之夙愿了。”
“很好，计划很顺利，剩下的三位使者也苏醒了，那就让一切在此终结，让人类回归最终的进化。”
“让初号机和Mark.06，完成我们的计划。”
NERV本部，MAGI发出了刺耳的警报声。
“图像为蓝色！是使徒！MAGI检测到使徒的反应！”
“一共有三个，三个使徒，从南面、北面临海，卫星轨道上空，分别接近了第三新东京市！”
“怎么可能！SEELE让剩余的使徒全部苏醒了吗！”
“他们疯了吗！在这种时候推进人类补完计划，万一出了什么差错，人类和莉莉丝本身都会消灭的啊！”
赤木律子不敢相信眼前发生的一幕，一向沉稳的SEELE居然激进到了这种程度。
是因为伊恩打乱了一切吗？
老人们认为，即便条件不完全，也必须在此刻推进计划，否则就没有机会了吗？
“第十四使徒、第十五使徒、第十六使徒，发现！”
从海域中现身的第十四使徒，它庞大的身躯离开了大海，海水从它的身躯上流淌而下。
出现在卫星轨道的第十五使徒，它散发出耀眼的光芒，以及，那环状的的第十六使徒，三个使徒从不同方向，朝着NERV本部进攻。
“可恶！知道使徒和莉莉丝接触不会引发冲击，所以故意让我们来承受使徒的攻击吗！”美里握拳砸桌。
亚当的胚胎在碇源堂手里，而碇源堂已经回归了SEELE，虽然不知道亚当的胚胎在哪个地方，但用脚后跟想，也知道SEELE就是知道亚当在自己手里，才这么放心大胆地让使徒来进攻。
“律子，我去找到明日香，让她驾驶二号机。”美里的手放在律子的肩膀上：“这里就拜托你了。”
“你小心。”赤木律子点头。
第三新东京市响起了接连不断的炮火声，自战队的坦克和军车，朝着天空发射导弹群，射击EVA系列量
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